همسانه سازی مولکولی ترادف رمزکننده ژن h+- atpase غشای پلاسمایی در گراس شورزی aeluropus littoralis

نویسندگان

احسان شکری

نجمه نصیری

قربانعلی نعمت زاده

چکیده

پمپ پروتونی h+-atpase یکی از پروتئین¬های مهم موجود در غشای پلاسمایی گیاهان می¬باشد که نقش مهّمی در فیزیولوژی مولکولی پاسخ به تنش ایفاء می¬کند. گراس aeluropus littoralis بواسطه مقاومت به برخی از استرس¬های محیطی مثل تنش شوری و عناصر سنگین مدل خوبی برای مطالعه ساختار و عملکرد این پمپ می¬باشد. در این مطالعه بعنوان نقطه آغاز، ترادف کامل ناحیه کدکننده این ژن در هالوفیت aeluropus littoralis شناسایی و همسانه¬سازی شد. اطلاعات اولیه بدست آمده نشان می¬دهد ترادف نوکلئوتیدی پمپ پروتونی h+-atpase غشای پلاسمایی یک ناحیه orf کامل بطول bp 2856 می¬باشد که همولوژی معنی¬داری با گونه¬های sorghum bicolor ، oryza sativa و zea mays دارد. همچنین ترادف آمینواسیدی این ژن، پپتیدی با وزن مولکولی 104567 دالتون متشکل از 951 اسیدآمینه را رمز می¬کند که از نظر نوع و ساختار دامین، بیشترین تطابق را با پروتئین¬های h+-atpase غشای پلاسمایی گیاهی و قارچی نوع سوم (type iii) از خانواده بزرگ پمپ¬های atpase p-type دارد. همردیفی مقایسه¬ای ترادف آمینواسیدی ژن h+-atpase غشای پلاسمایی گیاه aeluropus littoralis (alha) برخی گونه¬ها نشان می¬دهد که جایگزینی¬های نوکلئوتیدی نقاط حساس و عملکردی پروتئین را هدف قرار نداده و این مناطق در توالی مورد بررسی، حفاظت¬شده باقی مانده¬اند. در نهایت این ترادف با شماره دسترسیgi:346230720 در پایگاه داده ncbi ثبت گردید.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

همسانه سازی مولکولی ترادف رمزکننده ژن H+- ATPase غشای پلاسمایی در گراس شورزی Aeluropus littoralis

پمپ پروتونی H+-ATPase یکی از پروتئین¬های مهم موجود در غشای پلاسمایی گیاهان می¬باشد که نقش مهّمی در فیزیولوژی مولکولی پاسخ به تنش ایفاء می¬کند. گراس Aeluropus littoralis بواسطه مقاومت به برخی از استرس¬های محیطی مثل تنش شوری و عناصر سنگین مدل خوبی برای مطالعه ساختار و عملکرد این پمپ می¬باشد. در این مطالعه بعنوان نقطه آغاز، ترادف کامل ناحیه کدکننده این ژن در هالوفیت Aeluropus littoralis شناسایی و ه...

متن کامل

بررسی الگوی بیان ژن رمزکننده h+- atpase غشای پلاسمایی در aeluropus littoralis تحت شرایط تنش فلزات سنگین

به منظور بررسی الگوی بیان ژن h+- atpase غشای پلاسمایی در aeluropus littoralis تحت شرایط تنش فلزات سنگین بذور این گیاه پس از جمع آوری از منطقه پل فسا واقع در جنوب شهر شیراز در گلخانه بخش زراعت و اصلاح نباتات داشکده کشاورزی دانشگاه شیراز کشت شدند. این آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار انجام شد. پس از گذشت دو ماه تیمار‏های سرب، جیوه، نقره و کلرید سدیم هر کدام در دو سطح اعمال شدند. سپس در...

همسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن زیر واحد c آنزیم H+- ATPase واکوئلی در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis

سابقه و هدف : مدیریت جذب، انتقال، تبادل و کده بندی کردن یون ها و تنظیم دقیق نسبت های یونی در گیاهان به واسطه فعالیت مجموعه ای از ناقل ها، حامل ها و کانال های یونی صورت می پذیرد . پمپ یونی H+-ATPase واکوئلی، نقش مهّمی در ایجاد و حفظ شیب الکتروشیمیایی دارد و انتقال یون ها به داخل واکوئل سلول های گیاهی را تحت تأثیر قرار می دهد . فعالیت این پمپ باعث ایجاد نیروی محرکه پروتونی اولیه برای راه اندازی و ...

متن کامل

جداسازی ژن رمزکننده‏ی پمپh+-atpase غشای پلاسمایی از گیاه هالوفیت aeluropus littoralis

چکیده با هم ردیف سازی ژن های رمز کننده ی h+-atpase در گیاهان مختلف نواحی حفاظت شده شناسائی و برای آن ها آغازگرهای دجنره به منظور تکثیر ژن مذکور از گیاهان مورد نظر طراحی گردید. با استفاده از آغازگرهای طراحی شده قطعاتی از ژنوم گیاه aeluropus littoralis طی واکنش زنجیره‏ای پلیمراز تکثیر و توالی یابی گردید. بررسی ها نشان دادند که این توالی‏ها مربوط به ژن h+-atpase غشای پلاسمایی هستند. آران آ از گ...

15 صفحه اول

شناسایی و جداسازی سومین ایزوفرم رمزکننده پمپ پروتونی غشای پلاسمایی از aeluropus littoralis

نام خانوادگی: هاشمی نام: سارا شماره دانشجویی: 8736803 عنوان پایان نامه: شناسایی و جداسازی سومین ایزوفرم رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمایی از aeluropus littoralis استاد / اساتید راهنما: دکتر محمد رضا سیاهپوش- دکتر عباس عالم زاده استاد / اساتید مشاور: دکتر رضا مامقانی درجه تحصیلی: کارشناسی ارشد رشته: مهندسی کشاورزی گرایش: اصلاح نباتات دانشگاه: شهید چمران دانشکده: کشاورزی گروه: زراعت و ا...

Heavy metal regulation of plasma membrane H+-ATPase gene expression in halophyte Aeluropus littoralis

The present study was conducted to find the effect of three heavy metals, Ag, Hg and Pb on the expression level of a gene encoding plasma membrane H+-ATPase in Aeluropus littoralis. The experiment was laid out in a completely random design with three replications. The expression of the main gene was normalized to the expression of the housekeeping gene actin. Two 259 and 187 bp fragments were a...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
مجله پژوهش های سلولی و مولکولی

ناشر: انجمن زیست شناسی ایران

ISSN 2383-2738

دوره 27

شماره 3 2014

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023